一、是适时使用。

使用光合细菌的适宜水温为15℃～40℃，适水温为28℃～36℃，因而宜掌握在水温20℃以上时使用。注意阴雨天勿用。 

二、是与肥配用。

在池塘施用粪肥或化肥时，配合施用光合细菌效果更为明显。尤其可避免化肥用量过大、水质难以把握的缺点，并可防止藻类老化造成水质变坏。 

三、是视水质使用。

要根据水质肥瘦情况使用光合细菌。水肥时施用光合细菌可促进有机污染物的转化，避免有害物质积累，改善水体环境和培育天然饵料，保证水体溶氧；水瘦时首先施肥再使用光合细菌，这样有利于保持光合细菌在水体中的活力和繁殖优势，降低使用成本。此外，酸性水体不利于光合细菌的生长，应先施用生石灰，调节pH值后再使用光合细菌。 

四、是酌量使用。

光合细菌用于鱼池水质净化时，水温20℃以上期间，每立方米水体用2～5克光合细菌拌粉碎的干肥泥均匀撒于鱼池，以后每隔20天每立方米水体用1～2克光合细菌兑水全池泼洒。用于虾池水质净化时，水温20℃以上期间，每立方米水体用5～10克光合细菌拌肥泥均匀撒于虾池，以后每隔20天每立方米水体用2～10克光合细菌兑水全池泼洒。用于饲料添加投喂鱼虾时，以饲料投喂量的1%拌入，直接或加工后投喂（不受温度或压力影响）。用于疾病防治时，可连续定期使用，鱼池每立方米水体用1～2毫升，虾池每立方米水体用5～10毫升，兑水全池泼洒。 

五、是避免与消毒杀菌剂混施。

光合细菌制剂是活体细菌，药物对它有杀灭作用，不可与消毒杀菌剂同时使用。水体消毒后须经1周后方可使用，使光合细菌在水体中产生优势竞争性，抑制有害菌生长。 

六、是光合细菌在水产养殖中的使用功效

值春夏交际之时，天气非常沉闷，很多放养密度大一点的池塘，鱼浮头缺氧的现象严重，养殖户不得不连夜守候在池塘边，轮流值班，一见浮头，马上开增氧机，但是用了光合细菌的客户，就要轻松多了，每亩施用光合细菌5--7公斤后，则只要过两天，发现根本不用开增氧机了，鱼类浮头的现象没有了。水体也发生了一些变化，变得更加碧绿清爽了。